Как понятно из названия, проект Genome 10K изначально имел менее масштабные планы. Идея собрать 10 тысяч геномов родилась в 2009 году в Калифорнийском университете. За почти десятилетие начинание превратилось в огромный международный проект. Благодаря его успехам, а также значительному удешевлению технологий секвенирования генов, ученые решили поднять планку и объявить, что теперь их цель – расшифровать набор ДНК всех хордовых животных на Земле. А это около 66 000 видов!
Чтобы привлечь внимание к своему проекту, на прошлой неделе исследователи провели брифинг. По словам Дэвида Хаусслера, соучредителя G10K и директор Института геномики, еще десять лет участники проекта понятия не имели, сколько времени потребуется, чтобы добиться поставленной цели, и тем более сделать это по доступной цене.
За годы существования G10K выпустил около 100 геномов, но они были не очень подробными, отчасти из-за стоимости секвенирования. "То, что мы считали "геномом" в действительности не подходит для углубленных исследований. Я невероятно взволнован, что теперь у нас есть условия, чтобы все сделать правильно. Настало время, чтобы начать, и у нас нет оправданий, чтобы поступить иначе", – сказал Хаусслер.
Весь проект разделили на четыре этапа. В ходе первого соберут образцы 260 видов. Для этого необходимо 6 миллионов долларов, а собрано всего 2,5, так что финансирование остается препятствием для ученых. По словам невролога Эриха Джарвиса из Рокфеллеровского университета в Нью-Йорке, который возглавляет G10K, для реализации всех этапов понадобится около 600 миллионов долларов. Если сравнить с миллиардами, которые были затрачены на расшифровку совокупностей наследственного материала человека и мыши, такая сумма за десятки тысяч геномов – просто мелочи. Тем более улучшилась и эффективность методов секвенирования, поэтому ученые VGP нацелены получить еще более полные образцы.
Фото: s.mediasole.ru
Чтобы продемонстрировать потенциал проекта, ученые презентовали 15 качественных геномов животных из пяти классов хордовых. Среди них – канадская рысь, обыкновенный листонос (вид летучей мыши), утконос, калипта Анны (птица из семейства колибри), совиный попугай, черепаха Гуда (недавно обнаруженный в Мексике вид), рыба-ползун, зебровая амадина и пр. В настоящее время ведется секвенирование еще 30 видов.
Фото: i.redd.it
Ученые обещают учесть прошлые ошибки, чтобы достигнуть максимально эффективных результатов. Например, исследователи намерены воздерживаться от объединения мужских и женских хромосом в один геном – обычная практика, которая приводит к слишком большим погрешностям.
Кстати, все совокупности наследственного материала будут храниться и публиковаться в базе данных Genome Ark ("Геномный Ковчег"), цифровой библиотеки с открытым доступом.
Фото: supercoolpics.com
В рамках проекта будут рассмотрены важные вопросы в области биологии и болезней, геномики и сохранения видов. Последний пункт предполагает создание полного каталога всех видов позвоночных на Земле, что может служить надежной защитой от вымирания. При чем речь идет не только о предотвращении исчезновения животных, но и возрождения уже вымерших видов в будущем.
По словам Оливера Райера, соучредителя G10K и директора Института природоохранных исследований в Зоопарке Сан-Диего, реализация проекта может "трансформировать все сферы биологии". Так, это позволит ученым понять причины исчезновения видов, включая вредные мутации, генетические проблемы и инбридинг (скрещивание близкородственных форм в пределах одной популяции организмов).
Райер привел в пример калифорнийских кондоров. Открытие вредного рецессивного гена дало возможность идентифицировать птиц, которые являются носителями этой смертельной черты. "VGP позволит нам сохранить наше биологическое наследие", – подытожил ученый.
Напоминаем Вам, что в нашем журнале "Наука и техника" Вы найдете много интересных оригинальных статей о развитии авиации, кораблестроения, бронетехники, средств связи, космонавтики, точных, естественных и социальных наук. На сайте Вы можете приобрести электронную версию журнала за символические 60 р/15 грн.
В нашем интернет-магазине Вы найдете также постеры, магниты, календари с авиацией, кораблями, танками.